1959年新年伊始，北京矿业学院全院师生开展了丰富多彩的活动，迎接党代会的召开。

1959年3月13日至20日，在五道口教工俱乐部，中共北京矿业学院第三次党员代表大会隆重召开。出席大会的正式代表共239名，教育部、煤炭工业部及北京市高校党委派代表参加会议。

大会通过了《中共北京矿业学院第三届代表大会决议》，选举产生第三届党委委员27人、候补委员6人。同时选举产生了11位监委委员，候补监委委员２人。随后，党委会全体会议选举，经上级批准，吴子牧任党委书记，党委副书记共3人，党委常委共10人。

根据党中央、国务院关于教育工作的指示精神，为推进“党委领导下的院务委员会负责制”的实施，1959年4月17日，北京矿业学院举行了全院代表会议，选举产生了北京矿业学院第一届院务委员会。第三次党代会的召开和第一届院务委员会的成立，标志着学院领导体制由党委领导下的分工负责制向党委领导下的院务委员会负责制转轨的实现。